Protein–RNA interactions for Protein: P55895

RAG2, V(D)J recombination-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG2P55895 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAG2P55895 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAG2P55895 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAG2P55895 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAG2P55895 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAG2P55895 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAG2P55895 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAG2P55895 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAG2P55895 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAG2P55895 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAG2P55895 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAG2P55895 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAG2P55895 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAG2P55895 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAG2P55895 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAG2P55895 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAG2P55895 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAG2P55895 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAG2P55895 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAG2P55895 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAG2P55895 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAG2P55895 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAG2P55895 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAG2P55895 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAG2P55895 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAG2P55895 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAG2P55895 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAG2P55895 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RAG2P55895 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAG2P55895 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAG2P55895 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAG2P55895 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAG2P55895 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAG2P55895 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAG2P55895 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAG2P55895 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAG2P55895 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAG2P55895 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAG2P55895 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAG2P55895 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAG2P55895 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAG2P55895 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAG2P55895 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAG2P55895 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAG2P55895 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAG2P55895 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAG2P55895 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAG2P55895 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAG2P55895 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAG2P55895 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAG2P55895 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAG2P55895 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAG2P55895 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAG2P55895 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RAG2P55895 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAG2P55895 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAG2P55895 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAG2P55895 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAG2P55895 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAG2P55895 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAG2P55895 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAG2P55895 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAG2P55895 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RAG2P55895 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAG2P55895 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RAG2P55895 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RAG2P55895 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAG2P55895 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAG2P55895 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAG2P55895 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAG2P55895 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RAG2P55895 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAG2P55895 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAG2P55895 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAG2P55895 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAG2P55895 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAG2P55895 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RAG2P55895 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAG2P55895 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAG2P55895 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAG2P55895 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAG2P55895 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAG2P55895 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAG2P55895 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAG2P55895 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RAG2P55895 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAG2P55895 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAG2P55895 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAG2P55895 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAG2P55895 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAG2P55895 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAG2P55895 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAG2P55895 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RAG2P55895 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAG2P55895 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAG2P55895 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAG2P55895 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RAG2P55895 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAG2P55895 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAG2P55895 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms