Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
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PGGT1BP53609 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
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PGGT1BP53609 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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PGGT1BP53609 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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PGGT1BP53609 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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PGGT1BP53609 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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