Protein–RNA interactions for Protein: P53365

ARFIP2, Arfaptin-2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP2P53365 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1083.8 ms