Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA3P52797 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA3P52797 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA3P52797 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA3P52797 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA3P52797 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA3P52797 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA3P52797 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA3P52797 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA3P52797 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNA3P52797 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNA3P52797 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNA3P52797 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNA3P52797 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNA3P52797 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNA3P52797 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNA3P52797 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNA3P52797 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNA3P52797 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNA3P52797 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNA3P52797 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNA3P52797 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNA3P52797 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNA3P52797 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNA3P52797 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNA3P52797 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNA3P52797 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNA3P52797 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNA3P52797 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNA3P52797 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNA3P52797 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNA3P52797 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNA3P52797 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNA3P52797 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNA3P52797 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNA3P52797 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNA3P52797 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNA3P52797 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNA3P52797 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNA3P52797 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms