Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETV1P50549 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETV1P50549 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETV1P50549 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETV1P50549 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETV1P50549 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETV1P50549 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETV1P50549 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETV1P50549 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETV1P50549 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETV1P50549 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETV1P50549 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETV1P50549 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETV1P50549 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETV1P50549 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETV1P50549 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETV1P50549 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETV1P50549 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETV1P50549 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETV1P50549 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETV1P50549 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETV1P50549 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETV1P50549 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETV1P50549 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETV1P50549 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETV1P50549 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ETV1P50549 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ETV1P50549 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ETV1P50549 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ETV1P50549 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ETV1P50549 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ETV1P50549 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ETV1P50549 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ETV1P50549 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ETV1P50549 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ETV1P50549 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ETV1P50549 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ETV1P50549 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ETV1P50549 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ETV1P50549 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ETV1P50549 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ETV1P50549 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ETV1P50549 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ETV1P50549 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ETV1P50549 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ETV1P50549 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ETV1P50549 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ETV1P50549 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ETV1P50549 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ETV1P50549 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ETV1P50549 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ETV1P50549 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ETV1P50549 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ETV1P50549 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ETV1P50549 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ETV1P50549 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ETV1P50549 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ETV1P50549 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ETV1P50549 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ETV1P50549 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ETV1P50549 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETV1P50549 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETV1P50549 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETV1P50549 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETV1P50549 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETV1P50549 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ETV1P50549 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETV1P50549 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETV1P50549 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETV1P50549 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETV1P50549 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETV1P50549 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETV1P50549 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETV1P50549 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETV1P50549 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ETV1P50549 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETV1P50549 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETV1P50549 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ETV1P50549 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETV1P50549 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETV1P50549 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETV1P50549 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ETV1P50549 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETV1P50549 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETV1P50549 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETV1P50549 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ETV1P50549 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETV1P50549 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETV1P50549 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETV1P50549 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ETV1P50549 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETV1P50549 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETV1P50549 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETV1P50549 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETV1P50549 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETV1P50549 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETV1P50549 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETV1P50549 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETV1P50549 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETV1P50549 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms