Protein–RNA interactions for Protein: P48539

PCP4, Calmodulin regulator protein PCP4, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCP4P48539 AC012485.1-201ENST00000456601 2509 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PCP4P48539 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PCP4P48539 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PCP4P48539 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PCP4P48539 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PCP4P48539 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PCP4P48539 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PCP4P48539 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PCP4P48539 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PCP4P48539 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PCP4P48539 C10orf105-202ENST00000441508 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PCP4P48539 HSPA2-201ENST00000247207 2767 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PCP4P48539 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PCP4P48539 AKR1C8P-201ENST00000578467 2182 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PCP4P48539 RASA4-203ENST00000461209 3244 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PCP4P48539 LAMA3-202ENST00000313654 10661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PCP4P48539 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PCP4P48539 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PCP4P48539 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PCP4P48539 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PCP4P48539 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PCP4P48539 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PCP4P48539 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PCP4P48539 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PCP4P48539 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PCP4P48539 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PCP4P48539 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PCP4P48539 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PCP4P48539 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PCP4P48539 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PCP4P48539 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PCP4P48539 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PCP4P48539 PTGR2-205ENST00000555661 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PCP4P48539 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PCP4P48539 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PCP4P48539 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PCP4P48539 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PCP4P48539 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PCP4P48539 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PCP4P48539 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PCP4P48539 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PCP4P48539 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PCP4P48539 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PCP4P48539 FOXN3-219ENST00000615335 2421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PCP4P48539 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PCP4P48539 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PCP4P48539 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PCP4P48539 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PCP4P48539 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PCP4P48539 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PCP4P48539 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PCP4P48539 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PCP4P48539 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PCP4P48539 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PCP4P48539 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PCP4P48539 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PCP4P48539 RASA4CP-203ENST00000446874 3193 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PCP4P48539 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PCP4P48539 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PCP4P48539 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PCP4P48539 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PCP4P48539 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PCP4P48539 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PCP4P48539 ITGA2B-201ENST00000262407 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PCP4P48539 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PCP4P48539 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PCP4P48539 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PCP4P48539 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PCP4P48539 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PCP4P48539 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PCP4P48539 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PCP4P48539 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PCP4P48539 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PCP4P48539 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PCP4P48539 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PCP4P48539 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PCP4P48539 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PCP4P48539 C10orf90-202ENST00000356858 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PCP4P48539 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PCP4P48539 SRRT-215ENST00000614484 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PCP4P48539 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PCP4P48539 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PCP4P48539 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PCP4P48539 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PCP4P48539 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PCP4P48539 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PCP4P48539 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PCP4P48539 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PCP4P48539 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
PCP4P48539 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
PCP4P48539 ERAP1-201ENST00000296754 5495 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
PCP4P48539 C1orf167-202ENST00000433342 4545 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
PCP4P48539 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PCP4P48539 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PCP4P48539 PIGO-202ENST00000361778 2464 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PCP4P48539 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PCP4P48539 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PCP4P48539 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PCP4P48539 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PCP4P48539 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms