Protein–RNA interactions for Protein: P48431

SOX2, Transcription factor SOX-2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX2P48431 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOX2P48431 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOX2P48431 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOX2P48431 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOX2P48431 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOX2P48431 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SOX2P48431 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOX2P48431 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOX2P48431 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOX2P48431 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOX2P48431 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOX2P48431 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SOX2P48431 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOX2P48431 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOX2P48431 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SOX2P48431 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SOX2P48431 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOX2P48431 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOX2P48431 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOX2P48431 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOX2P48431 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOX2P48431 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOX2P48431 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOX2P48431 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOX2P48431 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SOX2P48431 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOX2P48431 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOX2P48431 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOX2P48431 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOX2P48431 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOX2P48431 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOX2P48431 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOX2P48431 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOX2P48431 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOX2P48431 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOX2P48431 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOX2P48431 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOX2P48431 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SOX2P48431 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SOX2P48431 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SOX2P48431 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SOX2P48431 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
SOX2P48431 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SOX2P48431 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SOX2P48431 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SOX2P48431 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SOX2P48431 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SOX2P48431 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOX2P48431 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOX2P48431 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOX2P48431 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SOX2P48431 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOX2P48431 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOX2P48431 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOX2P48431 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOX2P48431 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOX2P48431 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOX2P48431 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOX2P48431 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOX2P48431 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOX2P48431 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOX2P48431 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOX2P48431 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SOX2P48431 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOX2P48431 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOX2P48431 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOX2P48431 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOX2P48431 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOX2P48431 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOX2P48431 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOX2P48431 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOX2P48431 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOX2P48431 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOX2P48431 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOX2P48431 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOX2P48431 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOX2P48431 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOX2P48431 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOX2P48431 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOX2P48431 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOX2P48431 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOX2P48431 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOX2P48431 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOX2P48431 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOX2P48431 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOX2P48431 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOX2P48431 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOX2P48431 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOX2P48431 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOX2P48431 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOX2P48431 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOX2P48431 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOX2P48431 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOX2P48431 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOX2P48431 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOX2P48431 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOX2P48431 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOX2P48431 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SOX2P48431 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOX2P48431 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms