Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNA4P43681 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNA4P43681 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNA4P43681 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNA4P43681 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNA4P43681 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNA4P43681 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNA4P43681 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNA4P43681 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNA4P43681 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNA4P43681 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNA4P43681 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNA4P43681 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNA4P43681 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNA4P43681 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNA4P43681 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNA4P43681 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNA4P43681 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNA4P43681 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNA4P43681 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNA4P43681 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNA4P43681 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNA4P43681 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNA4P43681 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNA4P43681 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNA4P43681 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNA4P43681 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNA4P43681 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNA4P43681 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNA4P43681 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNA4P43681 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNA4P43681 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNA4P43681 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNA4P43681 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNA4P43681 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNA4P43681 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNA4P43681 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNA4P43681 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNA4P43681 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNA4P43681 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNA4P43681 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNA4P43681 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNA4P43681 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNA4P43681 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNA4P43681 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNA4P43681 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNA4P43681 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNA4P43681 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNA4P43681 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNA4P43681 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNA4P43681 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNA4P43681 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNA4P43681 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNA4P43681 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNA4P43681 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNA4P43681 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNA4P43681 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNA4P43681 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNA4P43681 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNA4P43681 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNA4P43681 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNA4P43681 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNA4P43681 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNA4P43681 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNA4P43681 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNA4P43681 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNA4P43681 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNA4P43681 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNA4P43681 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNA4P43681 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNA4P43681 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNA4P43681 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNA4P43681 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNA4P43681 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNA4P43681 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNA4P43681 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNA4P43681 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNA4P43681 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNA4P43681 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNA4P43681 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNA4P43681 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNA4P43681 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNA4P43681 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNA4P43681 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNA4P43681 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNA4P43681 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNA4P43681 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNA4P43681 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNA4P43681 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNA4P43681 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNA4P43681 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNA4P43681 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNA4P43681 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNA4P43681 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNA4P43681 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CHRNA4P43681 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CHRNA4P43681 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHRNA4P43681 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHRNA4P43681 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHRNA4P43681 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms