Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms