Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP5F1P24539 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP5F1P24539 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP5F1P24539 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP5F1P24539 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP5F1P24539 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP5F1P24539 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP5F1P24539 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP5F1P24539 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP5F1P24539 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP5F1P24539 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP5F1P24539 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP5F1P24539 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP5F1P24539 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP5F1P24539 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP5F1P24539 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP5F1P24539 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP5F1P24539 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP5F1P24539 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP5F1P24539 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP5F1P24539 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP5F1P24539 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP5F1P24539 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP5F1P24539 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP5F1P24539 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP5F1P24539 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP5F1P24539 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP5F1P24539 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP5F1P24539 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5F1P24539 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5F1P24539 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5F1P24539 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5F1P24539 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5F1P24539 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5F1P24539 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5F1P24539 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5F1P24539 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5F1P24539 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5F1P24539 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5F1P24539 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5F1P24539 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5F1P24539 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5F1P24539 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5F1P24539 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5F1P24539 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5F1P24539 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5F1P24539 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5F1P24539 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5F1P24539 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5F1P24539 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5F1P24539 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5F1P24539 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5F1P24539 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5F1P24539 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5F1P24539 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5F1P24539 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5F1P24539 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5F1P24539 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5F1P24539 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5F1P24539 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5F1P24539 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5F1P24539 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP5F1P24539 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP5F1P24539 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP5F1P24539 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP5F1P24539 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP5F1P24539 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP5F1P24539 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP5F1P24539 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP5F1P24539 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP5F1P24539 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP5F1P24539 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP5F1P24539 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP5F1P24539 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP5F1P24539 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP5F1P24539 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP5F1P24539 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP5F1P24539 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP5F1P24539 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP5F1P24539 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP5F1P24539 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP5F1P24539 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP5F1P24539 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP5F1P24539 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP5F1P24539 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms