Protein–RNA interactions for Protein: P21860

ERBB3, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERBB3P21860 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERBB3P21860 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERBB3P21860 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERBB3P21860 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERBB3P21860 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERBB3P21860 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERBB3P21860 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERBB3P21860 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERBB3P21860 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERBB3P21860 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERBB3P21860 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERBB3P21860 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ERBB3P21860 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERBB3P21860 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ERBB3P21860 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ERBB3P21860 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ERBB3P21860 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ERBB3P21860 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ERBB3P21860 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ERBB3P21860 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERBB3P21860 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERBB3P21860 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ERBB3P21860 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ERBB3P21860 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ERBB3P21860 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERBB3P21860 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERBB3P21860 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERBB3P21860 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERBB3P21860 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERBB3P21860 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERBB3P21860 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERBB3P21860 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERBB3P21860 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERBB3P21860 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERBB3P21860 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERBB3P21860 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERBB3P21860 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERBB3P21860 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERBB3P21860 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ERBB3P21860 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERBB3P21860 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ERBB3P21860 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERBB3P21860 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ERBB3P21860 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERBB3P21860 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERBB3P21860 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERBB3P21860 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERBB3P21860 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ERBB3P21860 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERBB3P21860 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERBB3P21860 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERBB3P21860 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERBB3P21860 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERBB3P21860 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERBB3P21860 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERBB3P21860 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERBB3P21860 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERBB3P21860 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ERBB3P21860 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERBB3P21860 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERBB3P21860 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERBB3P21860 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ERBB3P21860 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms