Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DESP17661 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DESP17661 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DESP17661 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DESP17661 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DESP17661 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DESP17661 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DESP17661 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DESP17661 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DESP17661 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DESP17661 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DESP17661 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DESP17661 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DESP17661 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DESP17661 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DESP17661 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DESP17661 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DESP17661 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DESP17661 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DESP17661 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DESP17661 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DESP17661 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DESP17661 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DESP17661 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DESP17661 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DESP17661 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
DESP17661 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DESP17661 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
DESP17661 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
DESP17661 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DESP17661 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DESP17661 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DESP17661 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DESP17661 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DESP17661 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DESP17661 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DESP17661 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DESP17661 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DESP17661 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DESP17661 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DESP17661 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DESP17661 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DESP17661 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DESP17661 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DESP17661 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DESP17661 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DESP17661 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DESP17661 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DESP17661 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DESP17661 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DESP17661 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DESP17661 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DESP17661 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DESP17661 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DESP17661 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DESP17661 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DESP17661 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DESP17661 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DESP17661 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DESP17661 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DESP17661 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DESP17661 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DESP17661 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DESP17661 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DESP17661 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DESP17661 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
DESP17661 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
DESP17661 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DESP17661 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
DESP17661 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DESP17661 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DESP17661 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
DESP17661 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
DESP17661 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DESP17661 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DESP17661 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DESP17661 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DESP17661 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DESP17661 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DESP17661 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DESP17661 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DESP17661 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DESP17661 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DESP17661 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DESP17661 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DESP17661 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DESP17661 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DESP17661 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DESP17661 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DESP17661 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DESP17661 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DESP17661 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DESP17661 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DESP17661 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DESP17661 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DESP17661 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DESP17661 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DESP17661 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DESP17661 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DESP17661 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms