Protein–RNA interactions for Protein: P17480

UBTF, Nucleolar transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBTFP17480 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
UBTFP17480 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
UBTFP17480 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
UBTFP17480 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
UBTFP17480 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
UBTFP17480 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
UBTFP17480 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
UBTFP17480 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
UBTFP17480 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
UBTFP17480 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
UBTFP17480 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
UBTFP17480 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
UBTFP17480 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
UBTFP17480 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
UBTFP17480 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
UBTFP17480 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
UBTFP17480 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
UBTFP17480 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
UBTFP17480 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
UBTFP17480 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
UBTFP17480 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
UBTFP17480 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
UBTFP17480 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
UBTFP17480 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
UBTFP17480 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
UBTFP17480 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
UBTFP17480 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
UBTFP17480 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
UBTFP17480 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
UBTFP17480 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
UBTFP17480 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
UBTFP17480 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
UBTFP17480 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
UBTFP17480 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
UBTFP17480 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
UBTFP17480 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
UBTFP17480 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
UBTFP17480 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
UBTFP17480 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
UBTFP17480 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
UBTFP17480 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
UBTFP17480 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
UBTFP17480 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
UBTFP17480 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
UBTFP17480 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
UBTFP17480 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
UBTFP17480 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
UBTFP17480 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
UBTFP17480 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
UBTFP17480 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
UBTFP17480 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
UBTFP17480 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
UBTFP17480 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
UBTFP17480 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
UBTFP17480 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
UBTFP17480 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
UBTFP17480 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
UBTFP17480 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
UBTFP17480 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
UBTFP17480 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
UBTFP17480 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
UBTFP17480 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
UBTFP17480 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
UBTFP17480 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
UBTFP17480 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
UBTFP17480 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
UBTFP17480 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
UBTFP17480 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
UBTFP17480 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
UBTFP17480 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
UBTFP17480 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
UBTFP17480 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
UBTFP17480 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
UBTFP17480 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
UBTFP17480 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
UBTFP17480 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
UBTFP17480 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
UBTFP17480 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
UBTFP17480 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
UBTFP17480 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
UBTFP17480 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
UBTFP17480 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
UBTFP17480 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
UBTFP17480 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
UBTFP17480 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
UBTFP17480 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
UBTFP17480 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
UBTFP17480 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
UBTFP17480 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
UBTFP17480 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
UBTFP17480 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
UBTFP17480 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
UBTFP17480 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
UBTFP17480 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
UBTFP17480 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
UBTFP17480 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
UBTFP17480 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
UBTFP17480 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
UBTFP17480 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
UBTFP17480 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms