Protein–RNA interactions for Protein: P17302

GJA1, Gap junction alpha-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA1P17302 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA1P17302 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA1P17302 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA1P17302 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA1P17302 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA1P17302 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA1P17302 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA1P17302 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA1P17302 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA1P17302 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA1P17302 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA1P17302 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA1P17302 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA1P17302 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA1P17302 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA1P17302 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA1P17302 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA1P17302 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA1P17302 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA1P17302 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA1P17302 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA1P17302 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA1P17302 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA1P17302 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA1P17302 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA1P17302 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA1P17302 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJA1P17302 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJA1P17302 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJA1P17302 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJA1P17302 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJA1P17302 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJA1P17302 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJA1P17302 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJA1P17302 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJA1P17302 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJA1P17302 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJA1P17302 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJA1P17302 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJA1P17302 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJA1P17302 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJA1P17302 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJA1P17302 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJA1P17302 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJA1P17302 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJA1P17302 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJA1P17302 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GJA1P17302 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJA1P17302 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJA1P17302 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJA1P17302 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJA1P17302 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJA1P17302 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJA1P17302 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJA1P17302 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJA1P17302 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJA1P17302 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJA1P17302 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJA1P17302 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJA1P17302 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJA1P17302 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJA1P17302 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJA1P17302 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJA1P17302 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJA1P17302 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJA1P17302 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJA1P17302 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJA1P17302 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJA1P17302 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJA1P17302 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJA1P17302 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJA1P17302 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJA1P17302 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJA1P17302 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJA1P17302 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJA1P17302 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GJA1P17302 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJA1P17302 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJA1P17302 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJA1P17302 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJA1P17302 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJA1P17302 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJA1P17302 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJA1P17302 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJA1P17302 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJA1P17302 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJA1P17302 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJA1P17302 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJA1P17302 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJA1P17302 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJA1P17302 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJA1P17302 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJA1P17302 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJA1P17302 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
GJA1P17302 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
GJA1P17302 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
GJA1P17302 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJA1P17302 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJA1P17302 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJA1P17302 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms