Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms