Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TNNT1P13805 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TNNT1P13805 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TNNT1P13805 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TNNT1P13805 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TNNT1P13805 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TNNT1P13805 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TNNT1P13805 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TNNT1P13805 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TNNT1P13805 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TNNT1P13805 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TNNT1P13805 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TNNT1P13805 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TNNT1P13805 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TNNT1P13805 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TNNT1P13805 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TNNT1P13805 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
TNNT1P13805 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TNNT1P13805 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TNNT1P13805 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TNNT1P13805 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TNNT1P13805 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNNT1P13805 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNNT1P13805 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNNT1P13805 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNNT1P13805 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNNT1P13805 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNNT1P13805 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNNT1P13805 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNNT1P13805 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNNT1P13805 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TNNT1P13805 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNNT1P13805 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNNT1P13805 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNNT1P13805 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNNT1P13805 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNNT1P13805 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNNT1P13805 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNNT1P13805 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNNT1P13805 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNNT1P13805 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNNT1P13805 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNNT1P13805 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNNT1P13805 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNNT1P13805 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNNT1P13805 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNNT1P13805 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNNT1P13805 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNNT1P13805 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNNT1P13805 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNNT1P13805 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNNT1P13805 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNNT1P13805 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNNT1P13805 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNNT1P13805 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNNT1P13805 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNNT1P13805 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNNT1P13805 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TNNT1P13805 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNNT1P13805 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNNT1P13805 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNNT1P13805 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNNT1P13805 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNNT1P13805 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNNT1P13805 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNNT1P13805 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNNT1P13805 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNNT1P13805 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNNT1P13805 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNNT1P13805 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNNT1P13805 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNNT1P13805 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNNT1P13805 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNNT1P13805 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNNT1P13805 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNNT1P13805 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNNT1P13805 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNNT1P13805 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNNT1P13805 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNNT1P13805 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNNT1P13805 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNNT1P13805 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNNT1P13805 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNNT1P13805 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNNT1P13805 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNNT1P13805 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNNT1P13805 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNNT1P13805 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNNT1P13805 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNNT1P13805 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TNNT1P13805 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNNT1P13805 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNNT1P13805 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNNT1P13805 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNNT1P13805 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNNT1P13805 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNNT1P13805 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNNT1P13805 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNNT1P13805 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNNT1P13805 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms