Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
BMP3P12645 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BMP3P12645 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BMP3P12645 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BMP3P12645 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BMP3P12645 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BMP3P12645 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BMP3P12645 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BMP3P12645 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BMP3P12645 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BMP3P12645 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BMP3P12645 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BMP3P12645 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
BMP3P12645 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BMP3P12645 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BMP3P12645 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BMP3P12645 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BMP3P12645 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BMP3P12645 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BMP3P12645 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BMP3P12645 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BMP3P12645 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BMP3P12645 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BMP3P12645 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BMP3P12645 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BMP3P12645 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BMP3P12645 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BMP3P12645 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BMP3P12645 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BMP3P12645 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BMP3P12645 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BMP3P12645 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BMP3P12645 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BMP3P12645 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BMP3P12645 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BMP3P12645 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BMP3P12645 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BMP3P12645 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BMP3P12645 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BMP3P12645 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BMP3P12645 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BMP3P12645 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
BMP3P12645 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BMP3P12645 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BMP3P12645 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BMP3P12645 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BMP3P12645 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BMP3P12645 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BMP3P12645 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BMP3P12645 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BMP3P12645 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BMP3P12645 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BMP3P12645 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BMP3P12645 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BMP3P12645 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BMP3P12645 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BMP3P12645 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BMP3P12645 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BMP3P12645 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BMP3P12645 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BMP3P12645 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BMP3P12645 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BMP3P12645 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BMP3P12645 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BMP3P12645 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BMP3P12645 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BMP3P12645 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BMP3P12645 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BMP3P12645 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BMP3P12645 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BMP3P12645 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BMP3P12645 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BMP3P12645 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BMP3P12645 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BMP3P12645 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BMP3P12645 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BMP3P12645 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
BMP3P12645 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BMP3P12645 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BMP3P12645 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BMP3P12645 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BMP3P12645 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BMP3P12645 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BMP3P12645 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BMP3P12645 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BMP3P12645 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BMP3P12645 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BMP3P12645 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BMP3P12645 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BMP3P12645 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BMP3P12645 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BMP3P12645 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BMP3P12645 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BMP3P12645 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BMP3P12645 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BMP3P12645 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BMP3P12645 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BMP3P12645 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
BMP3P12645 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BMP3P12645 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms