Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ODC1P11926 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ODC1P11926 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ODC1P11926 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ODC1P11926 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ODC1P11926 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ODC1P11926 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ODC1P11926 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ODC1P11926 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ODC1P11926 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ODC1P11926 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ODC1P11926 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ODC1P11926 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ODC1P11926 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ODC1P11926 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ODC1P11926 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ODC1P11926 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ODC1P11926 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ODC1P11926 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ODC1P11926 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ODC1P11926 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ODC1P11926 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ODC1P11926 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ODC1P11926 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ODC1P11926 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ODC1P11926 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ODC1P11926 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ODC1P11926 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ODC1P11926 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ODC1P11926 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ODC1P11926 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ODC1P11926 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ODC1P11926 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ODC1P11926 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ODC1P11926 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ODC1P11926 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ODC1P11926 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ODC1P11926 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ODC1P11926 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ODC1P11926 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ODC1P11926 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ODC1P11926 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ODC1P11926 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ODC1P11926 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ODC1P11926 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ODC1P11926 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ODC1P11926 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ODC1P11926 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ODC1P11926 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ODC1P11926 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ODC1P11926 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ODC1P11926 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ODC1P11926 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ODC1P11926 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ODC1P11926 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ODC1P11926 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ODC1P11926 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ODC1P11926 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ODC1P11926 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ODC1P11926 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ODC1P11926 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ODC1P11926 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ODC1P11926 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ODC1P11926 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ODC1P11926 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ODC1P11926 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ODC1P11926 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ODC1P11926 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ODC1P11926 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ODC1P11926 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ODC1P11926 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ODC1P11926 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ODC1P11926 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ODC1P11926 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ODC1P11926 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ODC1P11926 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ODC1P11926 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ODC1P11926 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ODC1P11926 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ODC1P11926 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ODC1P11926 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ODC1P11926 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ODC1P11926 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ODC1P11926 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ODC1P11926 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ODC1P11926 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ODC1P11926 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ODC1P11926 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ODC1P11926 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ODC1P11926 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ODC1P11926 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ODC1P11926 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ODC1P11926 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ODC1P11926 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ODC1P11926 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ODC1P11926 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ODC1P11926 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ODC1P11926 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ODC1P11926 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ODC1P11926 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms