Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms