Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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PKHD1P08F94 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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PKHD1P08F94 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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PKHD1P08F94 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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PKHD1P08F94 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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PKHD1P08F94 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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PKHD1P08F94 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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PKHD1P08F94 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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PKHD1P08F94 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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PKHD1P08F94 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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PKHD1P08F94 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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