Protein–RNA interactions for Protein: P08962

CD63, CD63 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD63P08962 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD63P08962 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD63P08962 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD63P08962 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD63P08962 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD63P08962 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD63P08962 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD63P08962 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD63P08962 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD63P08962 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD63P08962 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD63P08962 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD63P08962 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD63P08962 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD63P08962 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD63P08962 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD63P08962 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD63P08962 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD63P08962 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD63P08962 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD63P08962 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD63P08962 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD63P08962 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD63P08962 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD63P08962 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD63P08962 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD63P08962 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD63P08962 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD63P08962 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD63P08962 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD63P08962 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD63P08962 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD63P08962 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD63P08962 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD63P08962 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD63P08962 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD63P08962 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD63P08962 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD63P08962 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD63P08962 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD63P08962 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD63P08962 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD63P08962 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD63P08962 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD63P08962 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD63P08962 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD63P08962 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD63P08962 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD63P08962 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD63P08962 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD63P08962 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD63P08962 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD63P08962 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD63P08962 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD63P08962 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD63P08962 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD63P08962 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD63P08962 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD63P08962 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD63P08962 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD63P08962 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD63P08962 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD63P08962 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD63P08962 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD63P08962 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD63P08962 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD63P08962 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CD63P08962 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD63P08962 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD63P08962 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD63P08962 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD63P08962 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD63P08962 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD63P08962 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD63P08962 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD63P08962 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD63P08962 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD63P08962 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD63P08962 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD63P08962 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD63P08962 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CD63P08962 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CD63P08962 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD63P08962 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD63P08962 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD63P08962 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD63P08962 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD63P08962 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD63P08962 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD63P08962 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD63P08962 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD63P08962 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD63P08962 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD63P08962 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD63P08962 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD63P08962 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD63P08962 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD63P08962 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CD63P08962 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD63P08962 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms