Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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