Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFNB1P01574 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFNB1P01574 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFNB1P01574 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFNB1P01574 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFNB1P01574 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFNB1P01574 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFNB1P01574 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFNB1P01574 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFNB1P01574 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFNB1P01574 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFNB1P01574 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFNB1P01574 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFNB1P01574 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFNB1P01574 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFNB1P01574 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFNB1P01574 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFNB1P01574 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFNB1P01574 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
IFNB1P01574 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
IFNB1P01574 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFNB1P01574 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFNB1P01574 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFNB1P01574 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFNB1P01574 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFNB1P01574 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFNB1P01574 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFNB1P01574 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
IFNB1P01574 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.5 ms