Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms