Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMARCA5O60264 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms