Protein–RNA interactions for Protein: O14715

RGPD8, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD8O14715 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RGPD8O14715 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RGPD8O14715 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RGPD8O14715 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RGPD8O14715 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RGPD8O14715 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RGPD8O14715 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RGPD8O14715 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RGPD8O14715 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RGPD8O14715 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RGPD8O14715 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RGPD8O14715 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RGPD8O14715 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RGPD8O14715 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RGPD8O14715 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RGPD8O14715 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RGPD8O14715 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RGPD8O14715 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RGPD8O14715 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RGPD8O14715 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RGPD8O14715 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RGPD8O14715 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RGPD8O14715 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RGPD8O14715 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RGPD8O14715 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RGPD8O14715 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms