Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms