Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms