Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms