Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms