Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms