Protein–RNA interactions for Protein: A6NJU9

NPIPB13, Nuclear pore complex-interacting protein family member B13, humanhuman

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB13A6NJU9 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms