Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
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