Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR5

SLC8A2, Sodium/calcium exchanger 2, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A2Q9UPR5 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC8A2Q9UPR5 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC8A2Q9UPR5 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC8A2Q9UPR5 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC8A2Q9UPR5 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC8A2Q9UPR5 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC8A2Q9UPR5 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC8A2Q9UPR5 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC8A2Q9UPR5 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC8A2Q9UPR5 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC8A2Q9UPR5 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC8A2Q9UPR5 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC8A2Q9UPR5 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC8A2Q9UPR5 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC8A2Q9UPR5 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC8A2Q9UPR5 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC8A2Q9UPR5 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC8A2Q9UPR5 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC8A2Q9UPR5 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC8A2Q9UPR5 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC8A2Q9UPR5 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC8A2Q9UPR5 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC8A2Q9UPR5 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC8A2Q9UPR5 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC8A2Q9UPR5 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC8A2Q9UPR5 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC8A2Q9UPR5 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC8A2Q9UPR5 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC8A2Q9UPR5 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC8A2Q9UPR5 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC8A2Q9UPR5 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC8A2Q9UPR5 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC8A2Q9UPR5 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC8A2Q9UPR5 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC8A2Q9UPR5 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC8A2Q9UPR5 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC8A2Q9UPR5 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC8A2Q9UPR5 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC8A2Q9UPR5 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC8A2Q9UPR5 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC8A2Q9UPR5 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC8A2Q9UPR5 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC8A2Q9UPR5 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC8A2Q9UPR5 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC8A2Q9UPR5 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC8A2Q9UPR5 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC8A2Q9UPR5 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC8A2Q9UPR5 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC8A2Q9UPR5 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC8A2Q9UPR5 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC8A2Q9UPR5 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC8A2Q9UPR5 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC8A2Q9UPR5 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC8A2Q9UPR5 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC8A2Q9UPR5 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC8A2Q9UPR5 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC8A2Q9UPR5 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC8A2Q9UPR5 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC8A2Q9UPR5 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC8A2Q9UPR5 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC8A2Q9UPR5 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC8A2Q9UPR5 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC8A2Q9UPR5 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC8A2Q9UPR5 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC8A2Q9UPR5 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC8A2Q9UPR5 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC8A2Q9UPR5 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC8A2Q9UPR5 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC8A2Q9UPR5 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC8A2Q9UPR5 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC8A2Q9UPR5 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC8A2Q9UPR5 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC8A2Q9UPR5 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC8A2Q9UPR5 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC8A2Q9UPR5 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC8A2Q9UPR5 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC8A2Q9UPR5 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC8A2Q9UPR5 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC8A2Q9UPR5 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC8A2Q9UPR5 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC8A2Q9UPR5 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC8A2Q9UPR5 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC8A2Q9UPR5 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC8A2Q9UPR5 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC8A2Q9UPR5 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC8A2Q9UPR5 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC8A2Q9UPR5 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC8A2Q9UPR5 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC8A2Q9UPR5 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC8A2Q9UPR5 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC8A2Q9UPR5 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC8A2Q9UPR5 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC8A2Q9UPR5 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC8A2Q9UPR5 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC8A2Q9UPR5 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC8A2Q9UPR5 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC8A2Q9UPR5 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC8A2Q9UPR5 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC8A2Q9UPR5 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC8A2Q9UPR5 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms