Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

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Length 1,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP25Q9UHP3 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP25Q9UHP3 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
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