Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms