Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms