Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TDP1Q9NUW8 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TDP1Q9NUW8 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TDP1Q9NUW8 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TDP1Q9NUW8 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TDP1Q9NUW8 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TDP1Q9NUW8 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TDP1Q9NUW8 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TDP1Q9NUW8 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TDP1Q9NUW8 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TDP1Q9NUW8 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TDP1Q9NUW8 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TDP1Q9NUW8 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TDP1Q9NUW8 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TDP1Q9NUW8 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TDP1Q9NUW8 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TDP1Q9NUW8 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TDP1Q9NUW8 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TDP1Q9NUW8 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TDP1Q9NUW8 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TDP1Q9NUW8 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TDP1Q9NUW8 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TDP1Q9NUW8 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TDP1Q9NUW8 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TDP1Q9NUW8 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TDP1Q9NUW8 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TDP1Q9NUW8 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TDP1Q9NUW8 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TDP1Q9NUW8 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TDP1Q9NUW8 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TDP1Q9NUW8 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TDP1Q9NUW8 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TDP1Q9NUW8 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TDP1Q9NUW8 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TDP1Q9NUW8 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TDP1Q9NUW8 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TDP1Q9NUW8 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TDP1Q9NUW8 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TDP1Q9NUW8 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TDP1Q9NUW8 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
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