Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms