Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR8

KRTAP3-1, Keratin-associated protein 3-1, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP3-1Q9BYR8 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 CCL8-201ENST00000394620 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 AC007041.1-201ENST00000438989 1155 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 AC011451.1-201ENST00000591336 405 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms