Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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