Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTP6

ZBED2, Zinc finger BED domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED2Q9BTP6 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZBED2Q9BTP6 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZBED2Q9BTP6 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZBED2Q9BTP6 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZBED2Q9BTP6 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZBED2Q9BTP6 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZBED2Q9BTP6 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZBED2Q9BTP6 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZBED2Q9BTP6 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZBED2Q9BTP6 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZBED2Q9BTP6 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ZBED2Q9BTP6 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZBED2Q9BTP6 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZBED2Q9BTP6 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZBED2Q9BTP6 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZBED2Q9BTP6 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZBED2Q9BTP6 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZBED2Q9BTP6 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZBED2Q9BTP6 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZBED2Q9BTP6 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZBED2Q9BTP6 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZBED2Q9BTP6 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZBED2Q9BTP6 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZBED2Q9BTP6 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZBED2Q9BTP6 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZBED2Q9BTP6 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZBED2Q9BTP6 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ZBED2Q9BTP6 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZBED2Q9BTP6 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZBED2Q9BTP6 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZBED2Q9BTP6 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ZBED2Q9BTP6 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZBED2Q9BTP6 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZBED2Q9BTP6 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZBED2Q9BTP6 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZBED2Q9BTP6 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZBED2Q9BTP6 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZBED2Q9BTP6 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZBED2Q9BTP6 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZBED2Q9BTP6 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZBED2Q9BTP6 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZBED2Q9BTP6 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZBED2Q9BTP6 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZBED2Q9BTP6 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZBED2Q9BTP6 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZBED2Q9BTP6 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZBED2Q9BTP6 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZBED2Q9BTP6 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZBED2Q9BTP6 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZBED2Q9BTP6 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZBED2Q9BTP6 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZBED2Q9BTP6 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZBED2Q9BTP6 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZBED2Q9BTP6 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZBED2Q9BTP6 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ZBED2Q9BTP6 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZBED2Q9BTP6 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZBED2Q9BTP6 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZBED2Q9BTP6 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZBED2Q9BTP6 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZBED2Q9BTP6 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZBED2Q9BTP6 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZBED2Q9BTP6 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZBED2Q9BTP6 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZBED2Q9BTP6 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZBED2Q9BTP6 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZBED2Q9BTP6 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZBED2Q9BTP6 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZBED2Q9BTP6 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZBED2Q9BTP6 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZBED2Q9BTP6 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ZBED2Q9BTP6 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZBED2Q9BTP6 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZBED2Q9BTP6 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZBED2Q9BTP6 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ZBED2Q9BTP6 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZBED2Q9BTP6 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZBED2Q9BTP6 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZBED2Q9BTP6 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZBED2Q9BTP6 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZBED2Q9BTP6 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZBED2Q9BTP6 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZBED2Q9BTP6 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZBED2Q9BTP6 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZBED2Q9BTP6 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZBED2Q9BTP6 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZBED2Q9BTP6 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ZBED2Q9BTP6 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZBED2Q9BTP6 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ZBED2Q9BTP6 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ZBED2Q9BTP6 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ZBED2Q9BTP6 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZBED2Q9BTP6 AC009446.1-201ENST00000519840 808 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZBED2Q9BTP6 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZBED2Q9BTP6 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZBED2Q9BTP6 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZBED2Q9BTP6 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ZBED2Q9BTP6 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZBED2Q9BTP6 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZBED2Q9BTP6 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms