Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PIK3R4Q99570 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PIK3R4Q99570 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIK3R4Q99570 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms