Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms