Protein–RNA interactions for Protein: Q96M43

NBPF4, Neuroblastoma breakpoint family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF4Q96M43 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBPF4Q96M43 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms