Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms