Protein–RNA interactions for Protein: Q96AY2

EME1, Crossover junction endonuclease EME1, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EME1Q96AY2 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EME1Q96AY2 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EME1Q96AY2 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EME1Q96AY2 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EME1Q96AY2 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EME1Q96AY2 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EME1Q96AY2 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
EME1Q96AY2 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EME1Q96AY2 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EME1Q96AY2 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EME1Q96AY2 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
EME1Q96AY2 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EME1Q96AY2 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EME1Q96AY2 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EME1Q96AY2 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EME1Q96AY2 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EME1Q96AY2 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EME1Q96AY2 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EME1Q96AY2 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EME1Q96AY2 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EME1Q96AY2 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
EME1Q96AY2 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EME1Q96AY2 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EME1Q96AY2 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EME1Q96AY2 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EME1Q96AY2 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EME1Q96AY2 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EME1Q96AY2 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EME1Q96AY2 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EME1Q96AY2 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EME1Q96AY2 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EME1Q96AY2 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EME1Q96AY2 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EME1Q96AY2 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EME1Q96AY2 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EME1Q96AY2 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EME1Q96AY2 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EME1Q96AY2 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EME1Q96AY2 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EME1Q96AY2 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EME1Q96AY2 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EME1Q96AY2 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EME1Q96AY2 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EME1Q96AY2 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EME1Q96AY2 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EME1Q96AY2 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EME1Q96AY2 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EME1Q96AY2 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EME1Q96AY2 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EME1Q96AY2 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EME1Q96AY2 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EME1Q96AY2 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EME1Q96AY2 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
EME1Q96AY2 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EME1Q96AY2 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EME1Q96AY2 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EME1Q96AY2 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EME1Q96AY2 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EME1Q96AY2 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EME1Q96AY2 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EME1Q96AY2 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EME1Q96AY2 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EME1Q96AY2 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EME1Q96AY2 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EME1Q96AY2 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EME1Q96AY2 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EME1Q96AY2 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EME1Q96AY2 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EME1Q96AY2 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EME1Q96AY2 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EME1Q96AY2 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EME1Q96AY2 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EME1Q96AY2 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EME1Q96AY2 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EME1Q96AY2 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EME1Q96AY2 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EME1Q96AY2 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EME1Q96AY2 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EME1Q96AY2 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EME1Q96AY2 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EME1Q96AY2 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EME1Q96AY2 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EME1Q96AY2 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EME1Q96AY2 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EME1Q96AY2 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EME1Q96AY2 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EME1Q96AY2 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EME1Q96AY2 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
EME1Q96AY2 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EME1Q96AY2 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EME1Q96AY2 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EME1Q96AY2 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EME1Q96AY2 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EME1Q96AY2 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EME1Q96AY2 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EME1Q96AY2 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EME1Q96AY2 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
EME1Q96AY2 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
EME1Q96AY2 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
EME1Q96AY2 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms