Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms