Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms