Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC3

PYDC1, Pyrin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYDC1Q8WXC3 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PYDC1Q8WXC3 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PYDC1Q8WXC3 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PYDC1Q8WXC3 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PYDC1Q8WXC3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PYDC1Q8WXC3 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PYDC1Q8WXC3 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PYDC1Q8WXC3 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PYDC1Q8WXC3 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PYDC1Q8WXC3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PYDC1Q8WXC3 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PYDC1Q8WXC3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PYDC1Q8WXC3 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PYDC1Q8WXC3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PYDC1Q8WXC3 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PYDC1Q8WXC3 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PYDC1Q8WXC3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PYDC1Q8WXC3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PYDC1Q8WXC3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PYDC1Q8WXC3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PYDC1Q8WXC3 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PYDC1Q8WXC3 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PYDC1Q8WXC3 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PYDC1Q8WXC3 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PYDC1Q8WXC3 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PYDC1Q8WXC3 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PYDC1Q8WXC3 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PYDC1Q8WXC3 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PYDC1Q8WXC3 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PYDC1Q8WXC3 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PYDC1Q8WXC3 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PYDC1Q8WXC3 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PYDC1Q8WXC3 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PYDC1Q8WXC3 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PYDC1Q8WXC3 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PYDC1Q8WXC3 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PYDC1Q8WXC3 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PYDC1Q8WXC3 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PYDC1Q8WXC3 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PYDC1Q8WXC3 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PYDC1Q8WXC3 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PYDC1Q8WXC3 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PYDC1Q8WXC3 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PYDC1Q8WXC3 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PYDC1Q8WXC3 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PYDC1Q8WXC3 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PYDC1Q8WXC3 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PYDC1Q8WXC3 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PYDC1Q8WXC3 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PYDC1Q8WXC3 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PYDC1Q8WXC3 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PYDC1Q8WXC3 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PYDC1Q8WXC3 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PYDC1Q8WXC3 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PYDC1Q8WXC3 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PYDC1Q8WXC3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PYDC1Q8WXC3 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PYDC1Q8WXC3 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PYDC1Q8WXC3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PYDC1Q8WXC3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PYDC1Q8WXC3 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PYDC1Q8WXC3 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PYDC1Q8WXC3 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PYDC1Q8WXC3 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PYDC1Q8WXC3 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PYDC1Q8WXC3 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PYDC1Q8WXC3 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PYDC1Q8WXC3 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PYDC1Q8WXC3 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PYDC1Q8WXC3 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PYDC1Q8WXC3 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PYDC1Q8WXC3 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PYDC1Q8WXC3 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PYDC1Q8WXC3 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PYDC1Q8WXC3 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PYDC1Q8WXC3 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PYDC1Q8WXC3 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PYDC1Q8WXC3 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PYDC1Q8WXC3 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PYDC1Q8WXC3 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PYDC1Q8WXC3 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PYDC1Q8WXC3 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PYDC1Q8WXC3 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PYDC1Q8WXC3 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PYDC1Q8WXC3 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PYDC1Q8WXC3 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PYDC1Q8WXC3 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PYDC1Q8WXC3 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PYDC1Q8WXC3 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PYDC1Q8WXC3 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PYDC1Q8WXC3 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PYDC1Q8WXC3 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PYDC1Q8WXC3 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PYDC1Q8WXC3 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PYDC1Q8WXC3 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PYDC1Q8WXC3 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PYDC1Q8WXC3 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PYDC1Q8WXC3 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PYDC1Q8WXC3 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PYDC1Q8WXC3 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms